在藻類污水的處理中，為了降低投藥量，減少對環境的危害，并且提高除藻除濁效果，可以將聚合氯化鋁與復合型生物絮凝劑復配使用，藻類的表面帶有負電荷，其代謝產物吸附在膠體顆粒表面后增加了顆粒的負電性。
聚合氯化鋁鐵的水解產物帶正電荷，可以中和藻類表面的負電荷，是藻類的負電性降低，同時復合型生物絮凝劑的絮凝活性成分具有良好的水溶性，在水中呈線狀伸展后可對顆粒物質進行搜集，發揮其吸附架橋作用，在聚合氯化鋁鐵與復合型生物絮凝劑的協同作用下，藻類物質逐漸凝聚、增大，形成礬花并沉降。所以將聚合氯化鋁鐵與復合型生物型絮凝劑復配使用可以顯著降低投藥量，且對濁度的處理效果好，經過處理后絕大部分藻類被去除。
聚合氯化鋁不僅具有強烈的凝聚除濁效果，而且也具有明顯脫色及去除腐殖質的效果。在相同處理條件下達到佳絮凝作用，聚合鋁所需劑量比傳統鋁鹽要減少2/3之多。此外，聚合氯化鋁使用的pH范圍比傳統鋁鹽要寬的多。在相同劑量條件下，使用聚合氯化鋁能夠獲得比傳統鋁鹽更低的殘余濁度，因而可以以較低劑量得到相同的處理結果。 聚合氯化鋁的凈化處理效果特別明顯，特別是在處理高濁度水時，低溫低濁度水時，處理效果比明礬、聚合氯化鋁、聚合硫酸鐵、三氧化鐵效果好。對于低溫低濁度水，可不加堿性助劑和其它混凝劑，有無法比擬的效果。另外，聚合氯化鋁的混凝效果除表現為剩余濁度色度降低外，還有絮體形成塊，吸附性能高，泥渣過濾脫水性能好等特點。
